Estonya Süper Kupası (Estonya: Eesti Superkarikas), önceki Meistriliiga sezonunun şampiyonları ile Estonya Kupası'nın sahipleri arasında yapılan, Estonya futbolunun yıllık süper kupasıdır. Meistriliiga şampiyonları Estonya Kupası'nı da kazandıysa, kupa ikincisi ile finali oynar.
| Şampiyonluk | ||||
|---|---|---|---|---|
| FC Flora | 11 | |||
| FCI Levadia | 7 | |||
| Narva Trans | 2 | |||
| TVMK | 2 | |||
| Tallinna Sadam | 1 | |||
| Nõmme Kalju | 1 | |||
| Lantana | 1 | |||
| FCI Tallinn | 1 | |||
| Sene | Şampiyon (Manager) | Final Skor | Finalist/İkinci | Final Şehir |
| 1996 | Tallinna Sadam | 3–2 | Lantana | Maarjamäe Stadium |
| 1997 | Lantana | 3–0 | Tallinna Sadam | Maarjamäe Stadium |
| 1998 | FC Flora Teitur Thordarson | 3–2 | Tallinna Sadam | Kehtna Stadium |
| 1999 | Levadia | 4–1 | FC Flora | Kadriorg Stadium |
| 2000 | Levadia | 2–1 | Tulevik | Kuressaare linnastaadion |
| 2001 | Levadia | 2–0 3–0 | Narva Trans | Narva Kreenholm Stadium |
| 2002 | FC Flora Arno Pijpers | 1–1 (4–2 p) | Levadia II | Lilleküla artificial turf |
| 2003 | FC Flora Arno Pijpers | 3–1 | TVMK | A. Le Coq MiniArena |
| 2004 | FC Flora Arno Pijpers | 2–1 | Levadia | A. Le Coq MiniArena |
| 2005 | TVMK | 1–0 | Levadia | A. Le Coq MiniArena |
| 2006 | TVMK | 1–1 (3–2 p) | Flora | Sportland Arena |
| 2007 | Narva Trans | 2–1 | Levadia | Sportland Arena |
| 2008 | Narva Trans | 4–1 | Levadia | Sportland Arena |
| 2009 | FC Flora Tarmo Rüütli | 2–1 | Levadia | Sportland Arena |
| 2010 | Levadia | 2–0 | FC Flora | Sportland Arena |
| 2011 | FC Flora Martin Reim | 0–0 (5–3 p) | Levadia | Sportland Arena |
| 2012 | FC Flora Martin Reim | 4–0 | Narva Trans | Sportland Arena |
| 2013 | Levadia | 3–0 | Nõmme Kalju | Sportland Arena |
| 2014 | FC Flora Norbert Hurt | 1–0 | Levadia | Sportland Arena |
| 2015 | Levadia | 5–0 | Santos | Sportland Arena |
| 2016 | FC Flora Norbert Hurt | 3–0 | Nõmme Kalju | Sportland Arena |
| 2017 | FCI Tallinn | 5–0 | FC Flora | Sportland Arena |
| 2018 | FCI Levadia | 2–2 (4–3 p) | FC Flora | EJL Hall |
| 2019 | Nõmme Kalju | 3–2 | FCI Levadia | Sportland Arena |
| 2020 | FC Flora Jürgen Henn | 2–0 Rauno Sappinen, Rauno Alliku | Narva Trans | Narva Kalev-Fama Staadion |
| 2021 | FC Flora Jürgen Henn | 1–0 Rauno Sappinen | Paide Linnameeskond | A. Le Coq Arena, Tallinn |
| 2022 |